Niektóre metody wymagają lub umożliwiają wprowadzenie wcześniejszych informacji, które są wykorzystywane do kierowania tworzeniem trajektorii. Wykorzystanie wcześniejszych informacji może prowadzić do dokładniejszego określenia trajektorii, ale słabe wcześniejsze mogą zmylić algorytm lub wpłynąć na wyniki w kierunku oczekiwań. Przykładami wcześniejszych informacji, które można wykorzystać do wnioskowania o trajektorii, są wybór komórek początkowych, które znajdują się na początku trajektorii, liczba gałęzi na trajektorii oraz liczba stanów końcowych trajektorii.
Oprogramowanie
Monokl
Monocle najpierw stosuje różnicową formę testu ekspresji w celu zmniejszenia liczby genów, a następnie stosuje niezależne badanie składowe w celu dodatkowej redukcji wymiarowości. Aby zbudować trajektorię, Monocle oblicza minimalne drzewo rozpinające, a następnie znajduje najdłuższą połączoną ścieżkę w tym drzewie. Komórki są rzutowane na najbliższy punkt wzdłuż tej ścieżki.
Zdjęcie 280A | Wykres z sześcioma wierzchołkami. Wiele algorytmów wnioskowania o trajektorii używa wykresów do budowania trajektorii. | Użytkownik: AzaToth / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:6n-graf.svg) from Wikimedia Commons
Autor : Yavor Mendel
Komentarze
Prześlij komentarz