Dynamiczne genomy o wysokiej plastyczności są niezbędne, aby umożliwić patogenom, głównie bakteriom, przetrwanie w zmieniającym się środowisku. Przy pomocy wysokowydajnych metod sekwencjonowania i technologii in silico możliwe jest ujawnienie, porównanie i skatalogowanie wielu z tych dynamicznych zdarzeń genomicznych. Różnorodność genomowa jest ważna podczas wykrywania i leczenia patogenu, ponieważ zdarzenia te mogą zmienić usługę i skład patogenu. Istnieje potrzeba przeanalizowania więcej niż jednej konkatenacji genomu gatunku patogenu, aby zrozumieć mechanizmy patogenu. Genomika porównawcza to metodologia, która umożliwia naukowcom porównywanie genomów różnych gatunków i szczepów. Istnieje kilka przykładów udanych porównawczych badań genomiki, wśród nich analiza Listeria i Escherichia coli. W niektórych badaniach próbowano zająć się różnicą między drobnoustrojami chorobotwórczymi i niepatogennymi. Badanie to okazuje się trudne, mimo że jeden gatunek bakterii może mieć wiele szczepów, a zawartość genomu każdego z tych szczepów jest różna.
Zdjęcie 383A | microarray Układ zawiera komplementarny DNA (cDNA) do wielu sekwencji będących przedmiotem zainteresowania. CDNA fluoryzuje, gdy hybrydyzuje z pasującym fragmentem DNA w próbce. | National Cancer Institute / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) z Wikimedia Commons
Autor : Merim Kumars
Referencje:
Mikrobiologia Medyczna II: Sterylizacja, diagnostyka laboratoryjna i odpowiedź immunologiczna
Komentarze
Prześlij komentarz