Sekwencjonowanie na dużą skalę często ma na celu sekwencjonowanie bardzo długich fragmentów DNA, jak pokazują całe chromosomy, pomimo tego, że sekwencjonowanie na dużą skalę może być w podobny sposób użyte do generowania bardzo dużej liczby krótkich sekwencji, jak pokazano w phage display. W przypadku dłuższych celów, jak pokazują chromosomy, powszechne podejście polega na cięciu (enzymami ograniczającymi) lub ścinaniu (przy użyciu sił mechanicznych) dużych fragmentów DNA na krótsze fragmenty DNA. Rozdrobniona DNA można następnie sklonowano w DNA wektora i wzmocniony w gospodarzu bakteryjnym, jak pokazano Escherichia coli. Krótki DNA fragmenty oczyszczone z poszczególnych kolonii bakteryjnych są orientacyjnie sekwencjonowane i składane elektronicznie w jedną długą, ciągłą konkatenację. Badania wykazały, że dodanie etapu wyboru rozmiaru w celu zebrania fragmentów DNA o jednakowej wielkości może poprawić skuteczność sekwencjonowania i dokładność składania genomu. W tych badaniach automatyczne sortowanie okazało się bardziej powtarzalne i precyzyjne niż ręczne sortowanie żelu.
Zdjęcie 149A | Przykład wyników automatycznego sekwencjonowania terminacji łańcucha DNA. | Abizar w angielskiej Wikipedii / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) z Wikimedia Commons
Autor : Milos Pawlowski
Komentarze
Prześlij komentarz