Zastosowanie plazmidów jako techniki w biologii molekularnej jest wspierane przez oprogramowanie bioinformatyczne. Programy te rejestrują konkatenację DNA wektorów plazmidowych, pomagają przewidywać miejsca cięcia enzymów ograniczających i planują manipulacje. Przykładowe pakiety oprogramowania obsługujące mapy plazmidów to ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI i WebDSV. Te fragmenty oprogramowania pomagają przeprowadzić całe eksperymenty in silico przed wykonaniem eksperymentów na mokro.
Kolekcje plazmidów
Na przestrzeni lat powstało wiele plazmidów, a naukowcy przekazali je do baz danych, na przykład organizacji non-profit Addgene i BCCM / LMBP. Można zidentyfikować i pozyskać plazmidy z tych baz danych do badań. Ponadto badacze często przesyłają sekwencje plazmidów do bazy danych NCBI, z której można pobrać sekwencje określonych plazmidów.
Zdjęcie 239A | Schematyczne przedstawienie wektora pBR322 z miejscami ograniczenia zaznaczonymi na niebiesko. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons
Autor : Milos Pawlowski
Komentarze
Prześlij komentarz